新莊得名由來，即「新興的街莊」之意，因淡水河帶來的河港之利，是台灣北部開發最早的地區之一。在乾隆嘉慶年間(約西元1736~1820年)，舟船熙攘、商賈聚集，曾盛極一時，擁有「千帆林立新莊港，市肆聚千家燈火」美譽，有「一府、二鹿、三新莊」之美稱。日據時期(約西元1895~1945年)，新莊郡改隸台北州，轄新莊街、蘆洲庄、五股庄、林口庄，是當時之農業重鎮。又因臨近台北市，新莊的商業活動也跟著興盛起來。光復初期，民國35年，新莊鎮公所、鎮民代表會成立。 民國39年，泰山、新莊分治，新莊鎮之行政地位確立。後因工商發達，外地人相繼湧入，人口急增。 民國69年7月1日，新莊鎮升格改制為新莊市，改制後的新莊市，以縣轄市有限的資源，從事許多大型建設，逐漸跳脫了早期工業城市的刻板印象，躍升為一個工商繁榮、文化鼎盛、具高生活品質與社區意識的新興都會。 本所在民國39年8月25日正式成立。39年9月1日開辦，設有西盛、丹鳳兩個巡迴站。41年3月31日遷至新莊市公所，42年7月1日遷至本市中正路138號。 民國51年5月1日增建公共衛生資料館，53年7月1日增設新莊鎮鄉村衛生教導示範站。57年3月與台灣省公共衛生教學實驗院合辦借住本所。民國62年2月與實驗院分地段管理，直到72年才將地段歸還本所管理。民國75年8月5日本所徵購原租地重建，暫遷至本市新興街14號。民國77年7月6日完工遷回原址，地址變更為新莊市安寧街二號。民國90年5月28日門牌整編為中華路一段2號。民國92年12月29日因與捷運局共蓋共建，暫遷址於新莊市中港路48巷25號3樓（地藏庵活動中心）。民國98年7月25日完工遷回原址，地址為新北市新莊區中華路一段2號。 歷屆醫師兼主任：楊賜也、翁啟煊、程文彬、鄭英宏、張惠成、陳芳琪、林建義、陳敏菁、王森德、葉雅韻、吳佳穎；現任醫師兼主任為洪孜幸醫師。 

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